梅裏埃VITEK比(bi)傳統(tong)生(sheng)化(hua)鑒(jian)定(ding)更(geng)為(wei)直(zhi)接

　　梅裏埃VITEK梅裏埃鑒(jian)定(ding)卡(ka)是壹種(zhong)包含(han)多個檢測(ce)區(qu)域(yu)，同時進(jin)行多個生(sheng)化(hua)反應(ying)的特殊培(pei)養(yang)基(ji)鑒(jian)定(ding)系(xi)統，它可(ke)以用來鑒(jian)定(ding)腸桿菌(jun)科(ke)，葡萄球菌(jun)，李(li)斯特菌(jun)，鏈(lian)球菌(jun)，厭(yan)氧菌(jun)，革(ge)蘭(lan)氏(shi)陰性(xing)菌(jun)和(he)氧化酶(mei)陽(yang)性(xing)菌(jun)等(deng)。通(tong)過在(zai)各檢測(ce)區(qu)域(yu)生(sheng)化(hua)反應(ying)後(hou)不(bu)同的顏色變(bian)化(hua)組合，對照(zhao)測(ce)試(shi)編碼手(shou)冊，來鑒(jian)定(ding)微生(sheng)物(wu)的(de)種(zhong)類。

 

　　DNA測(ce)序進(jin)行菌(jun)種(zhong)鑒(jian)定(ding)的(de)結(jie)果(guo)比傳統(tong)生(sheng)化(hua)鑒(jian)定(ding)更(geng)為(wei)直(zhi)接，鑒(jian)定(ding)結(jie)果(guo)也更(geng)為(wei)可(ke)靠(kao)。測(ce)序不依(yi)賴菌(jun)種(zhong)本身(shen)特點，對所(suo)有菌(jun)種(zhong)均可使用。對(dui)於(yu)細(xi)菌(jun)，對(dui)16SrRNA進(jin)行分(fen)析(xi)鑒(jian)定(ding)，對(dui)於(yu)真(zhen)菌(jun)，對(dui)其ITS基因進(jin)行測(ce)序分(fen)析(xi)。

 

　　利(li)用特定(ding)引(yin)物PCR擴增(zeng)未(wei)知菌(jun)株(zhu)的16SrRNA基(ji)因或者ITS區，並(bing)進(jin)行DNA測(ce)序，與GenBank中(zhong)的(de)已知序列進(jin)行同源(yuan)性(xing)比(bi)較(jiao)後(hou)，判(pan)定(ding)細(xi)菌(jun)種(zhong)類，將(jiang)細(xi)菌(jun)劃(hua)分(fen)到(dao)屬(shu)或種(zhong)。

 

　　微基生(sheng)物(wu)專(zhuan)註微生(sheng)物(wu)多樣性(xing)研(yan)究(jiu)，為(wei)高(gao)校(xiao)、醫院(yuan)、研究(jiu)所(suo)等單(dan)位(wei)提供科(ke)研服(fu)務。不僅可以檢測(ce)土(tu)壤、水(shui)體(ti)、糞便(bian)、腸道(dao)內(nei)容(rong)物(wu)等(deng)樣本中(zhong)混(hun)合微生(sheng)物(wu)的(de)種(zhong)類及豐(feng)度，而(er)且還可(ke)以提供細(xi)菌(jun)、真(zhen)菌(jun)等(deng)純菌(jun)的(de)菌(jun)種(zhong)鑒(jian)定(ding)服(fu)務。

 

　　土(tu)壤、水(shui)體(ti)、糞便(bian)等樣本中(zhong)的(de)微生(sheng)物(wu)壹般(ban)為(wei)混(hun)合菌(jun)，需(xu)要在(zai)壹定(ding)條件下(xia)通(tong)過培(pei)養(yang)、分(fen)離、純化(hua)後(hou)，得(de)到(dao)純(chun)菌(jun)。對(dui)純的細(xi)菌(jun)、真(zhen)菌(jun)等(deng)菌(jun)種(zhong)，均可進(jin)行菌(jun)種(zhong)鑒(jian)定(ding)服(fu)務。

 

　　菌(jun)種(zhong)鑒(jian)定(ding)壹般(ban)是提取(qu)純菌(jun)A的(de)基因組DNA，然(ran)後(hou)PCR擴增(zeng)16srDNA片(pian)段，之後(hou)通(tong)過壹代測(ce)序或三(san)代測(ce)序檢測(ce)16SrDNA的(de)全(quan)長(chang)，與國(guo)際(ji)上(shang)的(de)數(shu)據庫進(jin)行Blast比(bi)對，默(mo)認選取(qu)比對(dui)結(jie)果(guo)中(zhong)相(xiang)似(si)性(xing)高(gao)的(de)前位的(de)物(wu)種(zhong)分(fen)類信息，之後(hou)構(gou)建(jian)系(xi)統發(fa)育樹，得(de)出(chu)樣本A與XX物種(zhong)的(de)相似(si)性(xing)高(gao)。